Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm39384-201ENSMUST00000213703 743 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC102139.1-201ENSMUST00000227000 251 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Klrb1a-201ENSMUST00000032512 1274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1259-201ENSMUST00000090695 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Sec22a-201ENSMUST00000043521 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm28600-202ENSMUST00000189502 1495 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC158986.1-201ENSMUST00000228391 3455 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm44116-201ENSMUST00000204269 1525 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC158537.1-201ENSMUST00000224637 1711 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 B130024G19Rik-203ENSMUST00000190320 5451 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Pum1-204ENSMUST00000105991 4614 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm38302-201ENSMUST00000191676 2076 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Prr15l-204ENSMUST00000107636 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm11271-201ENSMUST00000116054 440 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Rpl21-ps9-201ENSMUST00000119897 482 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm16249-201ENSMUST00000124055 1258 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Crisp2-203ENSMUST00000131699 538 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm8883-201ENSMUST00000187594 454 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cryab-203ENSMUST00000214962 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC161374.1-201ENSMUST00000224191 794 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Mir138-1-201ENSMUST00000083480 99 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Lrrc51-202ENSMUST00000098236 949 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Nlrp3-202ENSMUST00000101148 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm14896-201ENSMUST00000121311 1351 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm21043-201ENSMUST00000199316 1517 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Mmp27-201ENSMUST00000120900 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 4930509K18Rik-201ENSMUST00000144039 1810 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Smco3-201ENSMUST00000068293 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr691-202ENSMUST00000213290 2327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm42679-201ENSMUST00000197086 2906 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Prepl-201ENSMUST00000072406 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Smarca1-203ENSMUST00000101616 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm26843-201ENSMUST00000212304 2859 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm42490-201ENSMUST00000198595 2064 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cysltr2-201ENSMUST00000044664 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hoxd10P28359 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hoxd10P28359 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hoxd10P28359 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
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Hoxd10P28359 Olfr636-ps1-201ENSMUST00000134827 935 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm12963-203ENSMUST00000156271 388 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm16231-201ENSMUST00000160432 319 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm5154-201ENSMUST00000203971 399 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm18690-201ENSMUST00000204488 985 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm8637-201ENSMUST00000212919 1085 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Nqo2-204ENSMUST00000222740 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm20749-201ENSMUST00000186319 3492 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.5 ms