Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Cep57l1-210ENSMUST00000190022 1949 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gc-201ENSMUST00000049209 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 St18-212ENSMUST00000151281 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm7155-201ENSMUST00000121143 1671 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr550-202ENSMUST00000216524 4957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Tshr-204ENSMUST00000221216 1638 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm44141-201ENSMUST00000204231 1583 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm14035-201ENSMUST00000117596 1475 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gimd1-201ENSMUST00000163241 1413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4933406K04Rik-203ENSMUST00000135423 1391 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm44046-201ENSMUST00000203145 2678 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ifna14-201ENSMUST00000102808 570 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Trav14d-3-dv8-201ENSMUST00000103608 456 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Lrrc51-206ENSMUST00000106966 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm15422-201ENSMUST00000117453 541 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm6292-201ENSMUST00000120712 1095 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm16618-201ENSMUST00000134992 955 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 6430503K07Rik-201ENSMUST00000144411 476 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Mir1983-201ENSMUST00000157523 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm26351-201ENSMUST00000157532 232 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm23117-201ENSMUST00000158482 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm15934-201ENSMUST00000162062 525 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Lrrc51-210ENSMUST00000163903 939 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Traj54-201ENSMUST00000165071 54 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Klrc3-202ENSMUST00000170148 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm20702-201ENSMUST00000176181 460 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Trav9n-3-201ENSMUST00000177705 575 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Trav9d-3-201ENSMUST00000178252 575 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm29562-201ENSMUST00000190113 904 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 I830127L07Rik-202ENSMUST00000190944 405 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm43055-201ENSMUST00000198859 879 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Mcee-204ENSMUST00000206882 391 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm44785-201ENSMUST00000207379 620 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm4536-201ENSMUST00000209157 542 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm45246-201ENSMUST00000210820 367 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr863-ps1-201ENSMUST00000213073 929 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm34574-202ENSMUST00000219433 1108 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Atp8b3-202ENSMUST00000219648 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 AC154806.5-205ENSMUST00000228828 411 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Tmem216-201ENSMUST00000025569 1101 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 5530400C23Rik-201ENSMUST00000048459 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Lrrc51-201ENSMUST00000078448 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ube2c-202ENSMUST00000088248 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr557-201ENSMUST00000098218 1057 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm17017-201ENSMUST00000161540 2405 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Golph3l-207ENSMUST00000177390 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zfp426-208ENSMUST00000166005 1653 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Btn2a2-201ENSMUST00000041541 2226 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Zfand4-201ENSMUST00000036503 3123 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Stxbp5-201ENSMUST00000038213 8825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm28240-201ENSMUST00000187560 2053 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Vpreb1P13372 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms