Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFT2

Setd1b, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd1bQ8CFT2 Stat4-201ENSMUST00000027277 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Ppip5k1-201ENSMUST00000052029 5533 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Plk4-202ENSMUST00000167556 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 4933424M12Rik-202ENSMUST00000203451 1100 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 4933433N18Rik-201ENSMUST00000222134 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm36262-201ENSMUST00000223274 499 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gpr182-201ENSMUST00000079692 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Copg1-202ENSMUST00000113607 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm37321-201ENSMUST00000195742 1872 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm4951-201ENSMUST00000031549 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 F13b-201ENSMUST00000027615 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Cul4b-202ENSMUST00000050083 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Large1-201ENSMUST00000004497 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Olfr1063-ps1-201ENSMUST00000118807 942 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm13322-201ENSMUST00000152803 246 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm4489-201ENSMUST00000219576 517 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 4930503L19Rik-207ENSMUST00000212982 1415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Cdc40-201ENSMUST00000044166 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 AL589871.1-201ENSMUST00000221299 3561 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Nfkbiz-203ENSMUST00000114457 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Sycp1-202ENSMUST00000196988 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 AC138284.1-201ENSMUST00000214258 3236 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Rgs4-201ENSMUST00000027991 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Fmr1-204ENSMUST00000114655 4199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Mcf2-202ENSMUST00000063507 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Bdnf-208ENSMUST00000111049 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm7700-201ENSMUST00000120273 970 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm16110-201ENSMUST00000161473 892 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Rpl31-ps16-201ENSMUST00000181130 376 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm8860-201ENSMUST00000193160 445 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm45122-201ENSMUST00000206376 784 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm44705-201ENSMUST00000206719 339 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm44724-203ENSMUST00000208430 998 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 AC170913.1-201ENSMUST00000221418 758 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Fmr1-202ENSMUST00000114653 4058 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 Mef2c-227ENSMUST00000199432 3498 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Setd1bQ8CFT2 E330034G19Rik-204ENSMUST00000162224 1350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Iqch-202ENSMUST00000080527 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Clasp1-205ENSMUST00000185405 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Cd36-202ENSMUST00000165232 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Sub1-202ENSMUST00000110504 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm11105-201ENSMUST00000112781 478 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm22724-201ENSMUST00000158091 127 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm21772-201ENSMUST00000169213 478 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm9597-201ENSMUST00000171913 602 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm17126-201ENSMUST00000172276 523 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm21241-201ENSMUST00000179551 934 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 1810053B23Rik-202ENSMUST00000185364 590 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm29582-201ENSMUST00000185667 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Setd1bQ8CFT2 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms