Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 B020031H02Rik-201ENSMUST00000209977 3673 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm15413-201ENSMUST00000155101 1935 ntTSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm45873-201ENSMUST00000211865 1915 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Mef2c-222ENSMUST00000199019 4441 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Csde1-216ENSMUST00000199571 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm16025-202ENSMUST00000161923 2425 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Zfp111-203ENSMUST00000086006 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gfpt1-204ENSMUST00000113658 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 AW209491-201ENSMUST00000038690 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Cks1brt-202ENSMUST00000211617 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Adgrd1-203ENSMUST00000156437 4141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Heatr5a-201ENSMUST00000040583 7763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Vmn1r2-201ENSMUST00000105160 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm4919-201ENSMUST00000117825 604 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm14466-201ENSMUST00000119028 451 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm16026-205ENSMUST00000162923 641 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Vmn2r-ps84-201ENSMUST00000173377 897 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm20452-201ENSMUST00000174686 513 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm28425-202ENSMUST00000191542 621 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Mir1892-201ENSMUST00000197752 80 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 4933401H06Rik-201ENSMUST00000199058 827 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm4410-201ENSMUST00000199349 686 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm18689-201ENSMUST00000203969 902 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 AC153937.2-201ENSMUST00000218485 632 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 AC105167.1-201ENSMUST00000219966 253 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 AC154382.1-201ENSMUST00000220958 1282 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Vmn1r79-201ENSMUST00000062811 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Hbb-bh1-201ENSMUST00000063957 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Mep1a-202ENSMUST00000117137 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Mcmdc2-201ENSMUST00000052843 2826 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Bbs9-210ENSMUST00000147712 3495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Cbll1-205ENSMUST00000188326 1399 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Map3k7-203ENSMUST00000108183 5416 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Limch1-203ENSMUST00000117601 3157 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Phf3-201ENSMUST00000088310 7561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 4930528G23Rik-201ENSMUST00000124575 1723 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Tmem52b-201ENSMUST00000032263 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 A330015K06Rik-201ENSMUST00000195489 4286 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm6284-201ENSMUST00000209609 4287 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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Samd11Q1RNF8 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
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Samd11Q1RNF8 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
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Samd11Q1RNF8 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm26429-201ENSMUST00000104829 110 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm11338-201ENSMUST00000120086 1160 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm16138-201ENSMUST00000159341 821 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm27156-201ENSMUST00000184589 754 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
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Samd11Q1RNF8 1700041C23Rik-201ENSMUST00000185243 395 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 AC079644.2-201ENSMUST00000220581 322 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 AC108947.1-201ENSMUST00000224274 1000 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Rpl21-ps5-201ENSMUST00000095940 483 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Olfr1044-201ENSMUST00000099906 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Olfr802-203ENSMUST00000217576 5297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm32389-201ENSMUST00000209312 1621 ntTSL 3 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 2010310C07Rik-201ENSMUST00000187172 2226 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Samd11Q1RNF8 Gm37534-201ENSMUST00000194483 5222 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms