Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm11553-201ENSMUST00000120682 240 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm25435-201ENSMUST00000158277 267 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm7166-201ENSMUST00000199715 303 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC151904.2-201ENSMUST00000218683 1177 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC126685.1-201ENSMUST00000221001 121 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC154640.1-202ENSMUST00000227828 496 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Tmed6-201ENSMUST00000034393 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr933-201ENSMUST00000075680 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Zdhhc22-202ENSMUST00000222543 3462 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 CT010505.3-201ENSMUST00000227835 1651 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cbx3-204ENSMUST00000114446 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Uba1-202ENSMUST00000089217 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Olfr1364-202ENSMUST00000206526 2938 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Rgsl1-203ENSMUST00000141249 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Trpc4-201ENSMUST00000029311 3473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Zfp266-201ENSMUST00000068296 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Pak7-202ENSMUST00000077200 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 5330413P13Rik-202ENSMUST00000143453 3630 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Tex11-201ENSMUST00000009814 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cblb-205ENSMUST00000227756 3378 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm39041-201ENSMUST00000205557 3902 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Tex35-203ENSMUST00000119526 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm14070-201ENSMUST00000120773 428 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps111-201ENSMUST00000121014 997 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Vmn1r208-201ENSMUST00000124841 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 1700129C05Rik-202ENSMUST00000159858 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm28958-201ENSMUST00000185864 703 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm19088-201ENSMUST00000198800 566 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm6575-201ENSMUST00000222946 697 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Pknox2-202ENSMUST00000080754 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 4933430H16Rik-201ENSMUST00000209078 1319 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 4930554C24Rik-203ENSMUST00000216802 1346 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Pcdh9-204ENSMUST00000193901 6127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cldn2-201ENSMUST00000054889 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Efl1-205ENSMUST00000179489 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm6313-202ENSMUST00000150112 2562 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Adgrf4-204ENSMUST00000170723 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Tbx20-201ENSMUST00000052946 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Ccdc162-210ENSMUST00000189488 7260 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Polr2b-201ENSMUST00000031167 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Triqk-203ENSMUST00000183345 3545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 2310015D24Rik-202ENSMUST00000187920 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm26659-201ENSMUST00000181816 3655 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Klhl13-203ENSMUST00000115316 3064 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm42668-201ENSMUST00000200747 2487 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Eaf2-202ENSMUST00000075946 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Il1rl1-203ENSMUST00000173514 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Vmn1r196-202ENSMUST00000226245 5312 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm12890-201ENSMUST00000120885 373 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm22132-201ENSMUST00000175316 100 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Mir7020-201ENSMUST00000183787 70 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm27998-201ENSMUST00000184902 361 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm43089-201ENSMUST00000199162 275 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
Hoxd10P28359 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms