Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28682-201ENSMUST00000187430 696 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28773-201ENSMUST00000187925 696 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29422-201ENSMUST00000188062 694 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28734-201ENSMUST00000188104 696 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr972-203ENSMUST00000216167 1522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1426-201ENSMUST00000112952 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr554-202ENSMUST00000214841 2659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd38-201ENSMUST00000030964 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbd5-202ENSMUST00000112745 6037 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Farsb-201ENSMUST00000068333 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1e-203ENSMUST00000187541 14921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Far1-201ENSMUST00000033018 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
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