Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Speer3W4VSP1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Speer3W4VSP1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms