Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vamp5Q9Z2P8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vamp5Q9Z2P8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Vamp5Q9Z2P8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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