Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2I9

Sucla2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sucla2Q9Z2I9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sucla2Q9Z2I9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sucla2Q9Z2I9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms