Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Mbd1Q9Z2E2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Mbd1Q9Z2E2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms