Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mbd3Q9Z2D8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mbd3Q9Z2D8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms