Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccne2Q9Z238 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccne2Q9Z238 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms