Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ap3b1Q9Z1T1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ap3b1Q9Z1T1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms