Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lgr5Q9Z1P4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lgr5Q9Z1P4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lgr5Q9Z1P4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms