Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nek4Q9Z1J2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nek4Q9Z1J2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms