Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cpne6Q9Z140 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cpne6Q9Z140 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms