Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl8Q9Z121 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl8Q9Z121 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms