Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G0

Gipc1, PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1Q9Z0G0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gipc1Q9Z0G0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gipc1Q9Z0G0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms