Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pmfbp1Q9WVQ0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms