Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Clcn5Q9WVD4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clcn5Q9WVD4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clcn5Q9WVD4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clcn5Q9WVD4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clcn5Q9WVD4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clcn5Q9WVD4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clcn5Q9WVD4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Clcn5Q9WVD4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms