Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Snx1Q9WV80 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Snx1Q9WV80 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms