Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
VapaQ9WV55 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VapaQ9WV55 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms