Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK7

Opn3, Opsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn3Q9WUK7 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Opn3Q9WUK7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Opn3Q9WUK7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Opn3Q9WUK7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms