Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Skp1Q9WTX5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Skp1Q9WTX5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms