Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PrkraQ9WTX2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PrkraQ9WTX2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms