Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sema6cQ9WTM3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Sema6cQ9WTM3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms