Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Copg1Q9QZE5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Copg1Q9QZE5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Copg1Q9QZE5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms