Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
VapbQ9QY76 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
VapbQ9QY76 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms