Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Irx4Q9QY61 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Irx4Q9QY61 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms