Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pkp3Q9QY23 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pkp3Q9QY23 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms