Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
ChmQ9QXG2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ChmQ9QXG2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms