Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Clca3a1Q9QX15 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Clca3a1Q9QX15 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms