Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Dkk3Q9QUN9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Dkk3Q9QUN9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms