Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nkain4Q9JMG4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nkain4Q9JMG4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms