Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sfmbt1Q9JMD1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sfmbt1Q9JMD1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sfmbt1Q9JMD1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms