Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Dnaja4Q9JMC3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnaja4Q9JMC3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms