Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gkap1Q9JMB0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gkap1Q9JMB0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms