Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rabgef1Q9JM13 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rabgef1Q9JM13 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
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