Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aldh9a1Q9JLJ2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms