Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LitafQ9JLJ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LitafQ9JLJ0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms