Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tlr5Q9JLF7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tlr5Q9JLF7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tlr5Q9JLF7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms