Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Tgm1Q9JLF6 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tgm1Q9JLF6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Tgm1Q9JLF6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Tgm1Q9JLF6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Tgm1Q9JLF6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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Tgm1Q9JLF6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Tgm1Q9JLF6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tgm1Q9JLF6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
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Tgm1Q9JLF6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tgm1Q9JLF6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms