Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKU8

Lmx1a, LIM homeobox transcription factor 1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1aQ9JKU8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lmx1aQ9JKU8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Lmx1aQ9JKU8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms