Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chrac1Q9JKP8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms