Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap4m1Q9JKC7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ap4m1Q9JKC7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms