Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ4

Ube2j1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2j1Q9JJZ4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ube2j1Q9JJZ4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms