Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alyref2Q9JJW6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Alyref2Q9JJW6 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms