Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Efcc1Q9JJF6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efcc1Q9JJF6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms