Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Riox1Q9JJF3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Riox1Q9JJF3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms