Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Ccl28Q9JIL2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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